1958年10月29日，新中國第一個航空無線電系在北航率先建立，國內第一個航空電子類專業在北航誕生。1978年獲碩士學位授予權；1986年8月獲通信與電子系統博士學位授予權；1998年獲信息與通信工程一級學科博士學位授予權；2000年聯合獲交通工程一級學科博士學位授予權； 2002年10月成立電子信息工程學院；2003年獲電子科學與技術一級學科博士學位授予權；2005年獲光學工程一級學科的博士學位授予權、生物醫學工程一級學科的博士學位授予權。

歷經50多年，尤其是建院10年來，在學校的領導和支持下，學院幾屆黨政領導班子和廣大師生員工齊心協力、銳意進取，抓住211工程、985工程等建設契機。學院的綜合實力發生了歷史性的變化，實現了跨越式發展。目前學院擁有5個一級學科，通信與信息系統和電磁場與微波技術為國家重點二級學科，信息與通信工程、電子科學與技術、光學工程三個北京市一級重點學科，兩個國防重點學科，兩個教育部特色專業，9個本科專業，2個工程碩士領域，14個工學博士和碩士點，3個博士后流動站的學科群。下設信息與通信工程系、電子科學與技術系、光電與信息工程系和1個教學實驗實踐中心。現有學生2500余人，研究生與本科生比達到1:1。

學院現有教授41名，副教授49人，講師61人。擁有中國工程院院士2人，長江學者特聘教授2人，國家杰出青年基金獲得者3人，領域專家8人，教育部新世紀人才10人，卓越百人4人；另有自然基金創新研究群體1個，教育部創新團隊1個，科技部人才推進計劃創新團隊1個，國防創新團隊1個，北京市優秀教學團隊1個，校藍天創新團隊1個。

學院以學生培養為第一要務，選拔優秀生組成創新實驗班試驗班，實行一制三化的教學模式。學院將科研成果轉化為優質教學資源，開展研究型教學，提升教學質量。擁有國家級教學團隊1個、國家教學名師1人、北京市教學團隊1個、北京市教學名師32人、國家集成電路人才培養基地1個，國家級工程實踐教學基地2個，建有國家精品課程2門，國家重點、十一五國家級規劃、北京市精品教材多本。榮獲國家級教學成果二等獎2項、省部級優秀教學成果獎3項。投資2690萬元建立了本研一體的實驗教學中心，承擔電子信息類實驗教學課程56門，為學生科技實踐活動開放，是大學生電子創新基地。近年來本科生榮獲全國大學生電子競賽、信息安全大賽等國家級科技競賽一等獎20項 ；北京市科技競賽一等獎51項；北航馮如杯一等獎17項；并永久保留了馮如杯；挑戰杯特等獎1項；國家大學生創新創業計劃二十余項。學院對優秀學生實行本碩、本碩博連讀，本科畢業生一次上研率超過60%，就業率99%以上。

學院以學科建設為龍頭，緊密結合社會發展、國家安全和航空航天信息領域高新科學技術創新研究的需要，參與籌建了航空科學與技術國家實驗室，建有兩個國家級工程研究中心、四個省部級重點實驗室/中心、一個總裝軍用實驗室、一個國防科技重點實驗室分室，為總參陸航部電磁兼容技術支撐單位，成立了衛星導航重大項目辦公室和衛星導航應用研究所、測控通信技術研究所，有效支撐了學院學科的發展，顯著提高了學院科技創新能力。學院在空天通信、無人飛行器遙控遙測測控與通信、無線通信、數字電視與無線多媒體通信、二代衛星導航芯片組、衛星導航、現代空中交通管理、信息對抗、信息安全、飛行器電子綜合、衛星綜合電子測試、空天信息感知與處理、機載/星載合成孔徑成像、微波光子學、全光信息處理與獲取、電磁環境及電磁兼容、隱身及反隱身、專用集成電路與系統、情感信號處理等方面實力雄厚，上述研究方向屬于國內領先或國際先進水平。學院承擔了國家自然科學基金創新群體、杰出青年基金、國際合作重點項目、重點項目，國家973、863計劃，國家科技支撐計劃、國防重大預研和國防重大重點型號等項目百余項，近兩年作為首席單位承擔973項目兩項，主持國家重大科學儀器設備開發專項一項；4年來科研經費到款總計超過6億元。

近20年來，在航空航天信息尖端技術領域取得多項標志性成果，獲國家科技發明一等獎1項、國家科技進步一等獎3項、國家科技進步二等獎23項，教育部科技進步獎一等獎1項，民用航空局科技進步獎一等獎1項，國防科技進步獎二等獎1項，軍隊科技進步獎一等獎1項，軍隊科技進步獎二等獎2項等省部級二等獎以上30余項 近5年來，發表SCI收錄高水平論文近二百篇。近三年共獲授權發明專利160余項，其中66項已成功轉化應用。

學院積極推進國際化步伐，國際交流的規模不斷擴大，國家交流與合作已經成為學院培養高素質、創造性人才的新途徑。學院與英國愛丁堡、諾丁漢、澳大利亞悉尼大學等大學實行了聯合辦學，在歐盟Asia-Link項目資助下，學院與瑞典皇家工學院開展了教學與科研合作，建立了北航—瑞典皇家工學院無線通信研究中心；先后與美、英、法、德、加、澳、俄、及香港和臺灣等二十余個國家和地區的三十余所國際知名大學在科研、教師互訪、研究生培養等方面建立了合作關系，招收留學生。與歐空局、霍尼韋爾等著名科研機構和著名跨國公司進行科技合作，創建了聯合研究基地。每年邀請數十位國際著名學者來學院進行科研合作與學術交流，承辦了ISAPE2006、ISAPE2008、 APEMC2010、ChinaCom2010、2012國際電子工程教育論壇等國際學術大會。

學院是教育部與中國工程院聯合批準的高層次應用人才培養試點單位，與大唐電信聯合培養高水平博士生，與中航集團、航天科工及科技集團所屬單位建立了人才培養基地，與國家空管委創建了高級空管人才培訓基地。是航空學會航電與空管分會、電子學會DSP專家委員會的掛靠單位。累計培養學生過萬，其中本科生8000余名，碩士生 2062人，博士生462人，留學生100余人。為國防事業和國民經濟建設輸送了大批優秀人才，學院瞄準國家國防戰略需求，和國際學術前沿發展方向，通過學科交叉與融合，強化空天信息特色學科方向，按照學科方向建立科研基地和創新平臺，匯聚創新團隊，承擔國家重大項目，產生重大研究成果。